《孝庄秘史》的主题曲是《你》。主题曲《你》由我国著名歌手屠洪刚演唱，完整歌词为：你从天而降的你，落在我的马背上，如玉的模样，清水般的目光。一丝浅笑让我心发烫，你头也不回的你。展开你一双翅膀，寻觅着方向，方向在前方一声叹息，将我一生变凉。

你在那万人中央，感受那万丈荣光看不见你的眼睛，是否会藏着泪光。我没有那种力量，想忘也总不能忘，只等到漆黑夜晚，梦一回那曾经。心爱的姑娘，你从天而降的你。

落在我的马背上，如玉的模样，清水般的目光，一丝浅笑让我心发烫。你头也不回的你，展开你一双翅膀，寻觅着方向，方向在前方一声叹息。将我一生变凉，你在那万人中央。

感受那万丈荣光，看不见你的眼睛，是否会藏着泪光，我没有那种力量。想忘也总不能忘，只等到漆黑夜晚，梦一回那曾经，心爱的姑娘。